通常，我们把厌氧反应分为四个阶段：*阶段水解；第二阶段酸化；第三阶段酸性衰退；第四阶段甲烷化。

在水解阶段，固体物质溶解为溶解性物质，大分子物质降解为小分子物质，难生物降解物质转化为易生物降解物质。在酸化阶段，有机物降解为各种有机酸。水解和产酸进行得较快，难以把它们分开。起作用的主要微生物是水解菌和产酸菌。