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详解PCR反应循环参数

2022-9-13  阅读(729)

     循环次数 :一般为25 ~ 30次。循环数决定PCR扩增的产量。模板初始浓度低,可增加循环数以便达到有效的 扩增量。但循环数并不是可以无限增加的。一般循环数为30个左右,循环数超过30个以后,DNA聚合酶活性逐渐达到饱和,产物的量不再随循环数的增加而增加,出现了所谓的“平台期"。

1.png

循环参数:

1.预变性

模板DNA*变性与PCR酶的*激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。

2.变性步骤

循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列*变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不*,易造成扩增失败。

3.引物退火

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异性有较大影响。

4.引物延伸

引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

5.循环数

大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。

6.最后延伸

在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸*,并使单链产物退火成双链。







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